Project

PRJNA207719: Tissue specific transcriptome profiling

Navigation

Downloads

ISMARA results PRJNA207719: Tissue specific transcriptome profiling

ISMARA - Integrated System for Motif Actitivity Response Analysis is a free online tool that recognizes most important transcription factors that are changing their activity in a set of samples.

All motifs sorted by activity significance

Motif name	Z-value	Associated genes
rest	8.36	rest NCBI UniProt
hoxb6a+hoxb6b	7.50	hoxb6a NCBI UniProt hoxb6b NCBI UniProt hoxb6b NCBI UniProt
maza+mazb	6.23	mazb NCBI UniProt maza NCBI UniProt
arnt2	5.62	arnt2 NCBI UniProt
zbtb14	5.04	zbtb14 NCBI UniProt
hnf1a	4.92	hnf1a NCBI UniProt
zeb1a+zeb1b	4.85	zeb1b NCBI UniProt zeb1a NCBI UniProt zeb1b NCBI UniProt
hnf1ba+hnf1bb	4.85	hnf1ba NCBI UniProt hnf1bb NCBI UniProt hnf1ba NCBI UniProt
irf1b+irf2+irf2a	4.82	irf2a NCBI UniProt irf2 NCBI UniProt irf1b NCBI UniProt
yy1a+yy1b	4.70	yy1b NCBI UniProt yy1a NCBI UniProt
spi1a+spi1b	4.41	spi1b NCBI UniProt spi1a NCBI UniProt
spi2+spic	4.34	spic NCBI UniProt spi2 NCBI UniProt
grhl1	4.15	grhl1 NCBI UniProt
tfdp1a+tfdp1b	3.98	tfdp1b NCBI UniProt tfdp1a NCBI UniProt tfdp1a NCBI UniProt
hnf4a+hnf4b	3.97	hnf4a NCBI UniProt hnf4b NCBI UniProt hnf4a NCBI UniProt
irf10+irf8+irf9	3.93	irf9 NCBI UniProt irf10 NCBI UniProt irf8 NCBI UniProt
mef2d	3.87	mef2d NCBI UniProt
rfx3_rfx2+rfx4	3.75	rfx3 NCBI UniProt rfx2 NCBI UniProt rfx4 NCBI UniProt rfx4 NCBI UniProt
mef2aa+mef2ab	3.67	mef2aa NCBI UniProt mef2ab NCBI UniProt mef2ab NCBI UniProt
srfa+srfb	3.59	srfa NCBI UniProt srfb NCBI UniProt
irf5	3.57	irf5 NCBI UniProt
mafb+mafba+nrl	3.51	mafba NCBI UniProt mafb NCBI UniProt nrl NCBI UniProt
nrf1	3.51	nrf1 NCBI UniProt
nr3c1_ar	3.47	nr3c1 NCBI UniProt nr3c1 NCBI UniProt nr3c1 NCBI UniProt ar NCBI UniProt ar NCBI UniProt
snai1a	3.44	snai1a NCBI UniProt
foxp1a+foxp1b+foxp3a_foxg1b_foxp2_foxd1+foxd7_foxo1a+foxo1b	3.40	foxp1a NCBI UniProt foxp1b NCBI UniProt foxp3a NCBI UniProt foxg1b NCBI UniProt foxp2 NCBI UniProt foxd1 NCBI UniProt foxd7 NCBI UniProt foxo1b NCBI UniProt foxo1a NCBI UniProt
sox19a+sox2	3.38	sox19a NCBI UniProt sox2 NCBI UniProt sox19a NCBI UniProt
tbp	3.30	tbp NCBI UniProt
pou4f3_pou4f1+pou4f4	3.28	pou4f3 NCBI UniProt pou4f1 NCBI UniProt pou4f4 NCBI UniProt pou4f4 NCBI UniProt
mef2ca+mef2cb	3.14	mef2cb NCBI UniProt mef2ca NCBI UniProt
tcf12	3.08	tcf12 NCBI UniProt
pax2a+pax5	3.03	pax2a NCBI UniProt pax5 NCBI UniProt
elf2a+elf2b	3.02	elf2a NCBI UniProt elf2b NCBI UniProt elf2b NCBI UniProt
gata3	2.99	gata3 NCBI UniProt
klf12b	2.97	klf12b NCBI UniProt
nfia	2.87	nfia NCBI UniProt
onecut1+onecutl	2.85	onecut1 NCBI UniProt onecutl NCBI UniProt onecut1 NCBI UniProt
junba+junbb	2.84	junba NCBI UniProt junbb NCBI UniProt
tp53	2.78	tp53 NCBI UniProt tp53 NCBI UniProt
sp1	2.78	sp1 NCBI UniProt
tgif1	2.77	tgif1 NCBI UniProt
pbx1a+pbx1b+pbx2+pbx3a+pbx3b	2.71	pbx3b NCBI UniProt pbx2 NCBI UniProt pbx3a NCBI UniProt pbx1a NCBI UniProt pbx1b NCBI UniProt pbx3b NCBI UniProt
creb1a+creb1b+crema+cremb	2.69	crema NCBI UniProt creb1a NCBI UniProt creb1b NCBI UniProt cremb NCBI UniProt cremb NCBI UniProt cremb NCBI UniProt
runx1	2.66	runx1 NCBI UniProt
atf2+atf7a+atf7b_creb5a+creb5b	2.65	atf7a NCBI UniProt atf2 NCBI UniProt atf7b NCBI UniProt atf7b NCBI UniProt atf7b NCBI UniProt creb5b NCBI UniProt creb5a NCBI UniProt
e2f2_e2f5	2.65	e2f2 NCBI UniProt e2f5 NCBI UniProt
gata1b+gata2a	2.60	gata1b NCBI UniProt gata2a NCBI UniProt
gfi1aa+gfi1ab	2.56	gfi1aa NCBI UniProt gfi1ab NCBI UniProt gfi1ab NCBI UniProt
mecp2	2.42	mecp2 NCBI UniProt
foxa_foxa1_foxa2	2.38	foxa NCBI UniProt foxa NCBI UniProt foxa NCBI UniProt foxa1 NCBI UniProt foxa2 NCBI UniProt
nr6a1a	2.37	nr6a1a NCBI UniProt
myod1	2.32	myod1 NCBI UniProt
rargb_pparab	2.31	rargb NCBI UniProt pparab NCBI UniProt
figla	2.27	figla NCBI UniProt figla NCBI UniProt
e2f1_e2f7	2.24	e2f1 NCBI UniProt e2f7 NCBI UniProt
nr2f2	2.20	nr2f2 NCBI UniProt
patz1	2.17	patz1 NCBI UniProt
tcf7l1a+tcf7l1b+tcf7l2	2.16	tcf7l2 NCBI UniProt tcf7l1b NCBI UniProt tcf7l1a NCBI UniProt
nfkb1_rela	2.14	nfkb1 NCBI UniProt rela NCBI UniProt
mycn	2.13	mycn NCBI UniProt
irf1a	2.11	irf1a NCBI UniProt
tal1	2.11	tal1 NCBI UniProt
BX548005.1+smarcc2	2.10	smarcc2 NCBI UniProt BX548005.1 NCBI UniProt
clocka+clockb+npas2	2.09	clockb NCBI UniProt clocka NCBI UniProt npas2 NCBI UniProt npas2 NCBI UniProt
nfil3-5	2.08	nfil3-5 NCBI UniProt nfil3-5 NCBI UniProt
tbx15_tbx1_mgaa_tbx4	2.05	tbx15 NCBI UniProt tbx1 NCBI UniProt mgaa NCBI UniProt tbx4 NCBI UniProt tbx4 NCBI UniProt
zic2a+zic2b	2.05	zic2a NCBI UniProt zic2b NCBI UniProt zic2b NCBI UniProt
fli1b	2.03	fli1b NCBI UniProt
ptf1a+si:dkey-34f9.3	1.97	ptf1a NCBI UniProt si_dkey-34f9.3 NCBI UniProt
cdc5l	1.94	cdc5l NCBI UniProt
foxd2_foxd5	1.94	foxd2 NCBI UniProt foxd5 NCBI UniProt foxd5 NCBI UniProt
smad3a+smad3b	1.90	smad3b NCBI UniProt smad3a NCBI UniProt smad3a NCBI UniProt
mbd2	1.90	mbd2 NCBI UniProt
hoxa1a+hoxb1b-1+hoxc1a	1.88	hoxb1b-1 NCBI UniProt hoxc1a NCBI UniProt hoxa1a NCBI UniProt
mafa+mafbb	1.86	mafa NCBI UniProt mafbb NCBI UniProt mafbb NCBI UniProt
sp8a+sp8b_sp4_rsl1d1+sp3a_klf4	1.86	sp8a NCBI UniProt sp8b NCBI UniProt sp4 NCBI UniProt sp3a NCBI UniProt rsl1d1 NCBI UniProt klf4 NCBI UniProt
tbr1b_tbx16+tbx16l+tbx2a+tbx2b	1.85	tbr1b NCBI UniProt tbx2b NCBI UniProt tbx16l NCBI UniProt tbx16 NCBI UniProt tbx2a NCBI UniProt tbx2a NCBI UniProt tbx2b NCBI UniProt
pdx1_pbx4	1.84	pdx1 NCBI UniProt pdx1 NCBI UniProt pbx4 NCBI UniProt
mef2b	1.83	mef2b NCBI UniProt
pax2b	1.81	pax2b NCBI UniProt
myb+mybl1	1.81	mybl1 NCBI UniProt myb NCBI UniProt myb NCBI UniProt
onecut2	1.81	onecut2 NCBI UniProt
sox5	1.80	sox5 NCBI UniProt
sox21b	1.79	sox21b NCBI UniProt
etv5a+etv5b_elk1_elk4_etv1_elf1_erf+erfl3_gabpa_elk3	1.79	etv5b NCBI UniProt etv5a NCBI UniProt etv5a NCBI UniProt etv5b NCBI UniProt elk1 NCBI UniProt elk4 NCBI UniProt etv1 NCBI UniProt elf1 NCBI UniProt erfl3 NCBI UniProt erf NCBI UniProt gabpa NCBI UniProt gabpa NCBI UniProt elk3 NCBI UniProt elk3 NCBI UniProt
pou2f1b	1.79	pou2f1b NCBI UniProt
egr2a+egr2b	1.78	egr2b NCBI UniProt egr2a NCBI UniProt
foxn1	1.77	foxn1 NCBI UniProt
ddx28+nfatc1+nfatc2b+nfatc3a+nfatc3b+nfatc4	1.76	nfatc1 NCBI UniProt nfatc3b NCBI UniProt nfatc4 NCBI UniProt nfatc3a NCBI UniProt nfatc2b NCBI UniProt ddx28 NCBI UniProt
tfe3a+tfe3b	1.76	tfe3b NCBI UniProt tfe3a NCBI UniProt tfe3b NCBI UniProt
znf384l	1.76	znf384l NCBI UniProt
foxd3	1.75	foxd3 NCBI UniProt
tfap4	1.75	tfap4 NCBI UniProt
lef1	1.74	lef1 NCBI UniProt
cebpa	1.74	cebpa NCBI UniProt
tefa+tefb	1.73	tefa NCBI UniProt tefb NCBI UniProt tefa NCBI UniProt
hoxc9a	1.73	hoxc9a NCBI UniProt
nr4a2a	1.72	nr4a2a NCBI UniProt
prdm1a	1.71	prdm1a NCBI UniProt
barhl1a+barhl1b	1.70	barhl1b NCBI UniProt barhl1a NCBI UniProt barhl1a NCBI UniProt barhl1a NCBI UniProt barhl1b NCBI UniProt
cebpg	1.70	cebpg NCBI UniProt
neurod1	1.70	neurod1 NCBI UniProt
tfcp2+tfcp2l1+ubp1	1.69	ubp1 NCBI UniProt tfcp2l1 NCBI UniProt tfcp2 NCBI UniProt
atf3+jdp2b	1.69	atf3 NCBI UniProt jdp2b NCBI UniProt
pou4f2	1.69	pou4f2 NCBI UniProt
atf5a+atf5b	1.67	atf5a NCBI UniProt atf5b NCBI UniProt
foxa3	1.66	foxa3 NCBI UniProt
foxm1	1.65	foxm1 NCBI UniProt
hmx4	1.64	hmx4 NCBI UniProt hmx4 NCBI UniProt hmx4 NCBI UniProt
atf1	1.64	atf1 NCBI UniProt atf1 NCBI UniProt
si:dkey-149i17.7_zic1	1.63	si_dkey-149i17.7 NCBI UniProt zic1 NCBI UniProt
tcf21	1.63	tcf21 NCBI UniProt tcf21 NCBI UniProt
tcf3a+tcf3b	1.62	tcf3a NCBI UniProt tcf3b NCBI UniProt tcf3b NCBI UniProt
fosaa+fosab+fosl1a	1.62	fosl1a NCBI UniProt fosab NCBI UniProt fosaa NCBI UniProt
mafk	1.62	mafk NCBI UniProt
znf143b	1.61	znf143b NCBI UniProt znf143b NCBI UniProt znf143b NCBI UniProt
dlx1a	1.61	dlx1a NCBI UniProt
stat1a+stat2-1_stat1b	1.61	stat1a NCBI UniProt stat2-1 NCBI UniProt stat1b NCBI UniProt
jdp2a	1.60	jdp2a NCBI UniProt
mybl2b	1.59	mybl2b NCBI UniProt
irf4a+irf4b	1.57	irf4a NCBI UniProt irf4b NCBI UniProt irf4b NCBI UniProt
zbtb47b+znf652	1.57	znf652 NCBI UniProt zbtb47b NCBI UniProt
pou3f2a+pou3f2b+pou3f3a+pou3f3b	1.56	pou3f3a NCBI UniProt pou3f2a NCBI UniProt pou3f2b NCBI UniProt pou3f3b NCBI UniProt pou3f2b NCBI UniProt
msx1b+msx3	1.56	msx1b NCBI UniProt msx3 NCBI UniProt
irx5a+irx5b_irx3a+irx3b	1.55	irx5a NCBI UniProt irx5b NCBI UniProt irx3b NCBI UniProt irx3a NCBI UniProt
meox2b	1.55	meox2b NCBI UniProt meox2b NCBI UniProt
nr4a2b	1.54	nr4a2b NCBI UniProt
pitx2	1.54	pitx2 NCBI UniProt
foxi1+foxi2+foxi3a+foxi3b	1.53	foxi3b NCBI UniProt foxi3a NCBI UniProt foxi2 NCBI UniProt foxi1 NCBI UniProt foxi3b NCBI UniProt foxi3b NCBI UniProt foxi2 NCBI UniProt
gfi1b	1.52	gfi1b NCBI UniProt
pgr	1.52	pgr NCBI UniProt
smarcc1a+smarcc1b	1.52	smarcc1a NCBI UniProt smarcc1b NCBI UniProt
nr1h4	1.51	nr1h4 NCBI UniProt nr1h4 NCBI UniProt
nkx3-1	1.51	nkx3-1 NCBI UniProt
foxb1b+foxb2	1.51	foxb2 NCBI UniProt foxb1b NCBI UniProt foxb1b NCBI UniProt foxb1b NCBI UniProt
rbpjb	1.50	rbpjb NCBI UniProt
smad2_smad10a+smad4a_smad1	1.50	smad2 NCBI UniProt smad10a NCBI UniProt smad10a NCBI UniProt smad4a NCBI UniProt smad1 NCBI UniProt smad1 NCBI UniProt smad1 NCBI UniProt
onecut3a+onecut3b	1.48	onecut3a NCBI UniProt onecut3b NCBI UniProt
nr2f1a	1.48	nr2f1a NCBI UniProt
TCF4_id4_mespaa+mespab+mespba+mespbb	1.48	TCF4 NCBI UniProt id4 NCBI UniProt mespaa NCBI UniProt mespba NCBI UniProt mespab NCBI UniProt mespbb NCBI UniProt mespba NCBI UniProt mespaa NCBI UniProt
nr4a1	1.46	nr4a1 NCBI UniProt nr4a1 NCBI UniProt
vsx2	1.45	vsx2 NCBI UniProt
eomesa	1.44	eomesa NCBI UniProt
hnf4g	1.44	hnf4g NCBI UniProt
ikzf1	1.43	ikzf1 NCBI UniProt
esr1+esr2a+esr2b	1.42	esr1 NCBI UniProt esr2a NCBI UniProt esr2b NCBI UniProt esr1 NCBI UniProt
sox10	1.41	sox10 NCBI UniProt
cux2b	1.40	cux2b NCBI UniProt
nkx2.3+nkx2.7	1.40	nkx2.7 NCBI UniProt nkx2.3 NCBI UniProt nkx2.3 NCBI UniProt
pou2f3	1.39	pou2f3 NCBI UniProt
nr1d2a	1.38	nr1d2a NCBI UniProt
maff+mafga+mafgb	1.38	mafga NCBI UniProt maff NCBI UniProt mafgb NCBI UniProt maff NCBI UniProt
etv7	1.38	etv7 NCBI UniProt
lhx5	1.38	lhx5 NCBI UniProt
bhlha15_bhlhe23+si:ch211-196c10.13_bhlhe22	1.37	bhlha15 NCBI UniProt bhlhe23 NCBI UniProt si_ch211-196c10.13 NCBI UniProt bhlhe22 NCBI UniProt
bhlhe41_tfeb_usf2_tfec_max_mnta+mntb_mitfa+mitfb_mlxipl_usf1_usf1l_mxi1_srebf1	1.37	bhlhe41 NCBI UniProt bhlhe41 NCBI UniProt bhlhe41 NCBI UniProt tfeb NCBI UniProt usf2 NCBI UniProt tfec NCBI UniProt max NCBI UniProt mntb NCBI UniProt mnta NCBI UniProt mitfa NCBI UniProt mitfb NCBI UniProt mlxipl NCBI UniProt usf1 NCBI UniProt usf1l NCBI UniProt usf1l NCBI UniProt usf1l NCBI UniProt mxi1 NCBI UniProt mxi1 NCBI UniProt srebf1 NCBI UniProt
lhx3+lhx4	1.36	lhx3 NCBI UniProt lhx4 NCBI UniProt
zbtb7b	1.35	zbtb7b NCBI UniProt
msx1a	1.35	msx1a NCBI UniProt
nfe2l2a	1.35	nfe2l2a NCBI UniProt
hey2_hey1+heyl	1.34	hey2 NCBI UniProt heyl NCBI UniProt hey1 NCBI UniProt heyl NCBI UniProt
bach1a+bach1b+bach2a+bach2b	1.34	bach1b NCBI UniProt bach2b NCBI UniProt bach2a NCBI UniProt bach1a NCBI UniProt
ets2	1.33	ets2 NCBI UniProt
znf711	1.32	znf711 NCBI UniProt znf711 NCBI UniProt
wt1a+wt1b	1.32	wt1b NCBI UniProt wt1a NCBI UniProt
barx1	1.32	barx1 NCBI UniProt
nfil3-4+si:dkey-172o19.2	1.31	si_dkey-172o19.2 NCBI UniProt nfil3-4 NCBI UniProt
zbtb16a+zbtb16b	1.31	zbtb16a NCBI UniProt zbtb16b NCBI UniProt
msc	1.30	msc NCBI UniProt
arnt	1.30	arnt NCBI UniProt arnt NCBI UniProt
ehf	1.30	ehf NCBI UniProt ehf NCBI UniProt
zbtb18+zbtb42	1.29	zbtb18 NCBI UniProt zbtb42 NCBI UniProt
fosb+fosl2+si:ch211-153j24.3	1.29	fosl2 NCBI UniProt fosb NCBI UniProt si_ch211-153j24.3 NCBI UniProt
nfatc2a	1.28	nfatc2a NCBI UniProt
gsx1	1.28	gsx1 NCBI UniProt
dharma	1.28	dharma NCBI UniProt
runx2a+runx2b	1.28	runx2a NCBI UniProt runx2b NCBI UniProt
hoxb1a+hoxb1b-2	1.27	hoxb1a NCBI UniProt hoxb1b-2 NCBI UniProt
ikzf2	1.27	ikzf2 NCBI UniProt
cebpd	1.27	cebpd NCBI UniProt
hoxb3a	1.26	hoxb3a NCBI UniProt
sox14+sox14-1+sox21a	1.26	sox21a NCBI UniProt sox14 NCBI UniProt sox21a NCBI UniProt sox14-1 NCBI UniProt
tfap2b	1.26	tfap2b NCBI UniProt
gli1+gli2b	1.26	gli2b NCBI UniProt gli1 NCBI UniProt
tbx3a+tbx3b	1.26	tbx3a NCBI UniProt tbx3b NCBI UniProt
foxc1a+foxc1b	1.25	foxc1b NCBI UniProt foxc1a NCBI UniProt
arxa	1.25	arxa NCBI UniProt
SPDEF	1.23	SPDEF NCBI UniProt
cebpb	1.22	cebpb NCBI UniProt
foxj1a+foxj1b	1.22	foxj1b NCBI UniProt foxj1a NCBI UniProt
fev+fli1a_erg_etv2	1.22	fev NCBI UniProt fli1a NCBI UniProt erg NCBI UniProt etv2 NCBI UniProt
rarga	1.21	rarga NCBI UniProt
arid3a+arid3b+arid3c	1.21	arid3c NCBI UniProt arid3a NCBI UniProt arid3b NCBI UniProt arid3c NCBI UniProt
CABZ01066694.1	1.20	CABZ01066694.1 NCBI UniProt
myog	1.20	myog NCBI UniProt
hoxa13a+hoxa13b	1.20	hoxa13b NCBI UniProt hoxa13a NCBI UniProt
pparaa+pparda+ppardb	1.19	ppardb NCBI UniProt pparaa NCBI UniProt pparda NCBI UniProt
klf15+si:ch211-117k10.3	1.19	si_ch211-117k10.3 NCBI UniProt klf15 NCBI UniProt
hmbox1a+zgc:91944	1.19	hmbox1a NCBI UniProt zgc NCBI UniProt hmbox1a NCBI UniProt zgc NCBI UniProt
en1a	1.17	en1a NCBI UniProt
pou6f2	1.17	pou6f2 NCBI UniProt
esrrd+esrrga_esrrb_esrra+esrrgb	1.16	esrrga NCBI UniProt esrrd NCBI UniProt esrrb NCBI UniProt esrrgb NCBI UniProt esrra NCBI UniProt
arntl1a+arntl1b	1.16	arntl1a NCBI UniProt arntl1b NCBI UniProt arntl1b NCBI UniProt
hoxc13b+hoxd13a	1.16	hoxd13a NCBI UniProt hoxc13b NCBI UniProt
ebf1b	1.16	ebf1b NCBI UniProt
zfhx3+zfhx3a+zfhx4	1.15	zfhx3a NCBI UniProt zfhx4 NCBI UniProt zfhx3 NCBI UniProt
srebf2	1.15	srebf2 NCBI UniProt
en1b_en2a+en2b_gbx1_emx1	1.14	en1b NCBI UniProt en2a NCBI UniProt en2b NCBI UniProt en2a NCBI UniProt gbx1 NCBI UniProt emx1 NCBI UniProt
gcm2	1.14	gcm2 NCBI UniProt
pax1a+pax1b_pax9	1.14	pax1a NCBI UniProt pax1b NCBI UniProt pax9 NCBI UniProt
rel	1.13	rel NCBI UniProt
hoxc12a+hoxc12b	1.13	hoxc12a NCBI UniProt hoxc12b NCBI UniProt
osr1	1.13	osr1 NCBI UniProt
foxo4	1.13	foxo4 NCBI UniProt
hmx2_hmx3a	1.13	hmx2 NCBI UniProt hmx2 NCBI UniProt hmx3a NCBI UniProt hmx3a NCBI UniProt
myf6	1.12	myf6 NCBI UniProt
hoxa9a+hoxa9b	1.12	hoxa9b NCBI UniProt hoxa9a NCBI UniProt
klf13+zgc:153115	1.11	klf13 NCBI UniProt zgc NCBI UniProt
xbp1	1.11	xbp1 NCBI UniProt
prox1a+prox2+prox3	1.11	prox2 NCBI UniProt prox1a NCBI UniProt prox3 NCBI UniProt prox3 NCBI UniProt prox2 NCBI UniProt
e4f1+si:dkeyp-79b7.12	1.11	e4f1 NCBI UniProt si_dkeyp-79b7.12 NCBI UniProt
sox12	1.11	sox12